Instruksi Presiden (INPRES) No. 5/2007 tentang Percepatan Pembangunan Provinsi Papua dan Papua Barat mengamanatkan pembentukan Tim Pendamping yang bertanggung jawab untuk mengkoordinasikan dan menyelaraskan program-program dan kebijakan-kebijakan sektoral yang penting untuk pendukung program percepatan pembangunan kedua propinsi tersebut. Tim tersebut diketuai oleh Menteri Koordinasi Bidang Perekonomian, dengan 10 menteri lainnya, termasuk BAPPENAS dan Menteri Keuangan sebagai anggotanya. INPRES No 5/2007 juga menjelaskan lima bidang prioritas bagi perkembangan propinsi tersebut, yang mencakup perbaikan infrastruktur dasar yang dibutuhkan untuk memberikan akses layanan yang lebih baik kepada masyarakat yang tinggal di daerah-daerah pedesaan terpencil dan juga masyarakat yang tinggal diperbatasan negara. Secara khusus juga dijelaskan perlunya usaha-usaha khusus untuk mempercepat pembangunan kedua propinsi tersebut melalui pengembangan infrastruktur transportasi.